В академии организована работа 10-ти спортивных секций и 6-ти физкультурно-оздоровительных групп, в которых занимается около 200 студентов, что составляет примерно 10% от  контингента обучающихся по очной форме.

В 2020/21учебном году спортсмены академии приняли участие  более чем в 40-ка соревнованиях разного уровня. Чемпионами и призёрами стало более 30 студентов и сотрудников КГСХА.Команда КГСХА по армрестлингу – призер двух межрегиональных соревнований. Команда КГСХА по баскетболу – призер регионального этапа чемпионата Ассоциации студенческого баскетбола России. Команда КГСХА по легкой атлетике – серебряный призер чемпионата Костромской области. Студенты академии  Лапушкин Антон и Кузьмина Кристина – многократные призеры межрегиональных и областных соревнований по легкой атлетике. Матвиевский Антон – член сборной Костромской области по современному пятиборью, многократный призер соревнований различного уровня.

В течение учебного года - с октября по июнь -  на спортивных площадках академии и стадиона «Урожай» ежегодно проходит Спартакиада студентов КГСХА, включающая от 10 до 12-ти видов спорта, а также первенства по отдельным видам спорта: стрельбе, шахматам, настольному теннису, дартсу. Во внутривузовских спортивных мероприятиях приняло участие более 1000 человек.

В сдаче нормативов ВФСК «Готов к труду и обороне» приняло участие более 600 обучающихся. В текущем учебном году выполнили нормативы на «золотой», «серебряный» и «бронзовый» знаки отличия ГТО 76 человек.